Das Spiel Color Infection 3 wird nur mit der Maus und dem Anklicken der linken Maustaste gespielt. Beim Anklicken der linken Maustaste wird die Kugel in Gang gesetzt. Die gelbe Kugel muss mit der braunen Kugel zusammentreffen, damit das Level beendet ist. Dabei dienen die anderen Kugeln als Hilfsmittel, um an die braune Kugel zu gelangen. Brücken und andere Hilfsmittel werden ebenfalls mit der linken Maustaste angeklickt und fallen herunter. Spiele alle Level durch.